菌种活化是将保藏状态的菌种恢复到活跃状态的过程，以便进行进一步的实验或生产。
1、配置培养基：根据菌种的生长需求配置适宜的培养基(也可以选择适宜的商品化培养基)。
2、恢复菌种状态：将冷冻或其他形式保存的菌种恢复到室温状态，如解冻。
3、菌种复壮：将菌种接种到培养基中进行培养，进行多次传代，通常需要2-3代的培养后再进行后续实验。之所以在活化时需要进行多次传代是为了：①恢复活力：长期保存的菌种可能因为低温、营养缺乏等条件而导致活力下降，通过传代培养可以帮助菌种逐渐恢复到适宜的生长状态。②筛选健康菌株：在保存过程中，菌种中可能会出现活性降低或遗传性状改变的细胞，多次传代培养有助于筛选出具有良好生长特性和稳定遗传性状的健康菌株。③适应培养环境：保存时的条件与培养时的条件可能有所不同，传代培养可以让菌种逐步适应最终的培养环境，有利于后续的大规模培养或实验研究。④提高培养效率：经过传代培养的菌种，其细胞浓度更高，可以缩短种子在发酵阶段的延迟期，提高整体的培养效率。⑤减少变异风险：多次传代培养可以减少由于细胞分裂带来的潜在变异，保持菌种的遗传稳定性。⑥检验菌种纯度：传代培养过程中可以监控菌种的纯度，确保不会有杂菌污染，这对于实验结果的准确性至关重要。
4、挑选和扩大培养：挑选生长良好的菌落，再次接种到新的培养基中进行培养，以获得纯而壮的培养物。
在无菌操作条件下进行菌种的活化，以防止污染。
活化过程中可能需要调整培养条件，如温度、湿度和气体环境，以适应不同菌种的需求。
某些菌种可能需要特殊的培养基或添加剂，如血液、血清或抗生素，以促进其生长。
活化后的菌种应及时使用或妥善保存，以保持其活性。