1、取样原则：本标准中对应的检样量分别为0.1g（mL）、0.01g（mL）、0.001g（mL），根据样品限量值，查阅附录部分MPN表：
（1）无论固体或液体，当限量值为“＜3.0”或其它任意能在标准“表1”中查到的数值，则分别取1mL 1：10的样品匀液接种到3管单料LST肉汤管、分别取1mL 1：100的样品匀液接种到3管单料LST肉汤管、分别取1mL 1：1000的样品匀液接种到3管单料LST肉汤管；
（2）无论固体或液体样品的限量值为“＜0.3”或其它任意为MPN表中查到的数值缩小10倍的数值，则分别取10mL样品1:10稀释液接种到3管双料LST肉汤管、分别取1mL 1：10的样品匀液接种到3管单料LST肉汤管、分别取1mL 1：100的样品匀液接种到3管单料LST肉汤管（如蜂蜜的限量值为0.3MPN/g，即采取此做法）。
2、凡产酸或产气的LST管，都取1环接种GBLB肉汤管，凡BGLG产气者记为阳性。
第二法 大肠菌群平板计数法
1、VRBA培养相关问题（1）所用器皿是否需要灭菌？答：不需要。配制培养基所用到的锥形瓶、玻璃棒、勺子等均不需要灭菌，但要求一定要清洗干净，表面无污渍、无残留。煮沸完成后，取下锥形瓶，用一般常用的卫生纸（软纸）覆盖瓶口，用橡皮筋缠绕，待冷却至适宜温度即可倾注培养基。在倾注培养基时，须点燃酒精灯，稍微灼烧锥形瓶口。
（2）如何保持“煮沸2min”？答：可以用电磁炉或电热板进行加热煮沸，在该培养基即将煮沸时调低温度。实际操作时，不需要严格按照此要求进行，加热煮沸数秒即可。原因：本培养基很难保持煮沸2min，一旦煮沸，则培养基很快上涌、翻腾，若不调低温度或立刻采取其他措施，则培养基可在数秒内喷涌出来，严重者可喷涌2米以上、电磁炉周围1—2米范围内都是培养基飞溅的范围（实验室危险因子之一）。
（3）若培养基未用完，是否可以冷藏起来下次用？答：不可以。4789.28中已规定，固体培养基最多允许熔融1次（指的是经过高压灭菌冷却后的培养基还可以熔融一次后使用）。且VRBA培养基冷却后，再次熔融时非常容易喷涌，若温度控制不当，底部培养基熔融后很快就会发生喷涌（即培养基未完全熔融就会发生喷涌现象）。
（4）倾注完成后是否需要“覆盖一层”？如何覆盖？答：一般情况下不需要覆盖。在实际操作过程中，若检验员初次接触该食品（或食品品类），则有必要在倾注培养基后再覆盖一层（原因是不清楚该样品是否会发生蔓延）。而如此往复测试几次后，若该样品或食品品类均不存在蔓延现象，则以后的实验中都不需要进行覆盖。若重复多次测试后都有蔓延现象，则以后的检验中最好都进行覆盖，最好是在原培养基已凝固或半凝固（不会发生晃动）时再倾注一层培养基（“一层”是指缓慢倾注培养基至培养基刚好能够覆盖整个平皿）。
2、如何确定培养基上长的是不是大肠菌群？答：建议新手们认真按照标准进行证实试验，此证实试验简单易操作，每一次VRBA上有菌落生长都进行证实试验，如此往复3-4次，对于哪种形态才是大肠菌群已经能够了然于心。
第二部分、GB/T 4789.3-2003 《大肠菌群测定》——标准解读
1、由于MPN表中给出的检样量为1mL（g）、0.1mL（g）0.01mL（g）三个稀释度，所以：
（1）无论固体或液体，当限量值为“＜30”或其它任意能在标准“表1”中查到的数值，则分别取10mL 1：10的样品匀液接种到3管双料乳糖胆盐发酵管、分别取1mL 1：10的样品匀液接种到3管单料乳糖胆盐发酵管、分别取1mL 1：100的样品匀液接种到3管单料乳糖胆盐发酵管（有时限量值≤300，也建议同样操作）；
（2）若液体样品的限量值为“＜3”，则分别取10mL样品原液接种到3管双料乳糖胆盐发酵管、分别取1mL样品原液接种到3管单料乳糖胆盐发酵管、分别取1mL 1：10的样品匀液接种到3管单料乳糖胆盐发酵管，9管皆为阴性则符合该限量值。
2、大肠菌群在EMB培养基上的典型形态特征，参考GB 5750-2006中总大肠菌群发酵法相关章节。但仍然建议：一旦有菌落数生长，无论是否为典型形态，都应挑取进行革兰氏染色及证实试验。
3、最后一次证实试验，凡乳糖发酵管产气（无论气泡大小）且革兰氏染色镜检为阴性则判定为大肠菌群阳性。
以GB 2726-2016《食品安全国家标准 熟肉制品》为例，其中大肠菌群指标如下：
该标准提到的检验方法并未写明是按GB 4789.3-2016中的第一法还是第二法检测，那现在按检测标准来分析一下：
1. GB/T 4789.3-2003的检测结果单位为MPN/100克或MPN/100毫升”
2. GB 4789.3-2016中的第一法中的检测单位为“MPN/克或MPN/毫升”
3. GB 4789.3-201